Merian werd in 1647 in Frankfurt geboren in een familie van kunstenaars en drukkers. Al op jonge leeftijd raakte ze in de ban van de natuur; eerst van bloemen, dan van insecten, met name rupsen en motten, beginnend met zijderupsen op de leeftijd van dertien. In een tijd dat velen geloofden dat insecten spontaan uit planten of rottend vlees kwamen, bewees ze dat ze ongelijk hadden door lange en gedetailleerde observaties van hoe rupsen veranderden in vlinders en motten, en op tweeëntwintigjarige leeftijd een rijk geïllustreerd boek over het onderwerp publiceerde.
Ongelukkig getrouwd, verhuisde ze naar Nederland en vestigde zich in 1691 in Amsterdam. Daar verdiende ze de kost met de verkoop van botanische schilderijen, waarbij ze ten volle profiteerde van de Nederlandse passie voor zowel kunst als bloemen. In die tijd bloeide het Nederlandse rijk op en Amsterdam was een mondiaal centrum. Specimen van bijzondere en mooie planten en dieren stroomden binnen uit Oost- en West-Indië. De oogverblindende kleuren, vormen en afmetingen van deze tropische organismen inspireerden haar om ze te ontdekken, te observeren, te verzamelen en te schilderen in hun oorspronkelijke natuurlijke leefgebied. Op 10 juli 1699 vertrok ze naar Paramaribo, de hoofdstad van Nederlands-Guyana die nu de onafhankelijke staat Suriname is. Merian was de eerste Europese vrouw – en een van de eerste Europeanen – die voor een wetenschappelijke expeditie naar het Amazoneregenwoud trok.
Het noorden van het Amazonegebied bestaande uit: Suriname, Brits Guyana (nu Guyana) en Frans Guyana maken deel uit van hetzelfde grote Amazonelandschap, dat haar nieuwe woonplaats zou worden. Dat betekende dat Paramaribo ideaal gelegen was om insecten en planten die onbekend waren in Europa te verzamelen, bestuderen en illustreren. Op dat moment waren maar weinig gedroogde exemplaren van deze soorten in Europese musea aanwezig. De prachtige en expressieve schilderijen die ze creëerde zijn niet alleen opmerkelijk nauwkeurig op de manier waarop ze zijn afgebeeld, maar ook in de illustratie van de interacties tussen de planten en de dieren. Deze waren revolutionair. Zoals opgemerkt, illustreerde Merian interacties en strijd tussen organismen in de Amazone 150 jaar voordat Haeckel de term ‘ecologie’ bedacht en meer dan 160 jaar voorafgaand aan Darwin’s publicatie van zijn onsterfelijke werk over hoe soorten strijden om te overleven.